Numérique et recherche en santé et sciences du vivant

Description

Ce MOOC a pour objectif de donner aux chercheurs, professionnels de la recherche en santé et sciences du vivant et futurs chercheurs français et francophones les éléments nécessaires pour s'adapter à l’évolution des pratiques de recherche en santé (de la gestion à la communication et à la diffusion de ressources scientifiques) et leur permettre de prendre en main les outils numériques associés. Il permettra en outre de saisir certains nouveaux enjeux technologiques, sociaux, juridiques, éthiques tels que le libre accès à la publication scientifique, le partage de données scientifiques ainsi que les changements de méthodologies que le numérique peut introduire dans les pratiques de recherche (data driven research, recherche participative). Aussi, chaque séance fera appel à une diversité d’experts (chercheurs, ingénieurs de recherche, bibliothécaires, médecins, juristes etc.) pour apporter un éclairage sur les enjeux de ces nouveaux usages. Des screencasts proposeront des retours d'expérience de chercheurs et permettront de découvrir ainsi un ensemble d’outils numériques open source utilisés en recherche (logiciel R, Zotero, Github, Python).
 Les échanges entre participants et intervenants de ce MOOC et les réflexions générées dans ce cadre constitueront une source importante, une matière vive, qui viendra nourrir la pratique. Il sera aussi question pour chaque participant de se questionner sur ses propres pratiques et de construire au fil du MOOC des objectifs concrets pour les faire évoluer.

Plan de cours

• Séance 0 : Recherche à l'ère du numérique : quelles transformations ? (séance d'introduction)
  • [ Interview ] Science à l'ère du numérique : quelles transformations ?
    [ Screencast ] Présentation du MOOC
• Séance 1 : S'appuyer sur des ressources scientifiques existantes
  • [ Interview ] Bibliothèque et numérique : quels défis et quels rôles à jouer?
    [ Screencast ] Savoir gérer sa bibliographie avec Zotero
• Séance 2 : Collecter/produire des données scientifiques
  • [ Interview ] Numérique et collecte de données en santé
    [ Screencast ] Daydream : un exemple de collecte de données en ligne
• Séance 3 : Traiter/analyser des données scientifiques
  • [ Interview ] Données et numérique : quelles "réelles" transformations ?
    [ Screencast 1] Recherche en neurogénétique : exemple d'utilisation de Python et de Github
    [ Screencast 2 ] Analyse de données en épidémiologie avec R
    [ Screencast 3 ] Une introduction à Git et Github
• Séance 4 : Archiver/partager des données scientifiques : données de santé, données sensibles
  • [ Interview 1 ] Des données partagées aux données ouvertes en recherche
    [ Interview 2 ] Quelles protections pour les données de santé en recherche ?
    [ Screencast ] Partage de données médicales anonymisées
• Séance 5 : Partager ses résultats scientifiques : écrire et publier
  • [ Interview 1 ] Publier sa recherche à l'ère du numérique et Open Access
    [ Interview 2 ] Droit d’auteur et licences Creative Commons : quelques précisions utiles avant de publier
    [ Screencast 1 ] Déposer un article dans HAL
    [ Screencast 2 ] Modifier un dépôt dans HAL
• Séance 6 : Faire partie d'une communauté scientifique
  • [ Interview ] Panorama de l'évaluation scientifique et de ses évolutions (2 parties)
    [ Screencast 1 ] Présence en ligne : retour d'expérience d'un chercheur
    [ Screencast 2 ] Faire connaître ses activités de recherche : comparaison de Zenodo et Figshare
    [ Screencast 3] Communiquer sur ses recherches : présence "en ligne".
• Séance 7 : Nouvelles formes d’interaction en recherche et enjeux éthiques
  • [ Interview 1 ] Ouvrir le processus de recherche : des sciences citoyennes à la recherche participative
    [ Interview 2 ] La recherche à l'ère du numérique, regards de sociologue
    [ Screencast ] Blogs scientifiques : Strange Stuff and Funky Things et le c@fé des sciences