Modeling of Infectious Diseases

Description

Nous vivons dans un monde très connecté, où les maladies infectieuses trouvent des opportunités de se propager à l'échelle mondiale comme jamais auparavant dans l'histoire de l'humanité. Cela soulève de nouveaux défis en santé publique pour les épidémiologistes, les médecins et les biologistes, engagés dans la prévention et le traitement des maladies infectieuses. Les modèles mathématiques et informatiques peuvent contribuer à cet effort interdisciplinaire et concerté. Ils peuvent faire des prédictions à court terme sur la progression des épidémies, aider à analyser des scénarios sur l'issue de l'épidémie et informer sur l'impact des interventions de santé publique.

Plan de cours

• Chapitre 1 - Introduction
  • C1-1- Histoire et philosophie de la modélisation mathématique des maladies infectieuses
• Chapitre 2 - Bases de la modélisation
  • C2-1 Compartmental models and flow diagrams
    C2-2 Intervals of interest in infectious diseases
    C2-3 Modeling multiple strains and cross infections
    C2-4 Mixing models and transmission models
    C2-5 How to write a deterministic model based on a flow diagram?
• Chapitre 3 - The SIR model
  • C3-1 The SIR model: formulation, analysis, discussion
    C3-2 Estimating R - time dependent
    C3-3 A more complete SIR model
    C3-4 SIR versus practice
• Chapitre 4 - R0 and its calculation
  • C4-1 R0 and R calculation: a general recipe
    C4-2 Example 1: R0 of the SIR model
    C4-3 Example 2: R0 of the SEIR model
    C4-4 Example 3: R0 for a vector-borne disease model
    C4-5 Example 4: R0 for a 2-patch model for HIV
    C4-6 Estimating R0 and R - exponential growth vide
    C4-7 The R0 review
• Chapitre 5 - Modelling interventions
  • C5-1 Understanding the effect of interventions
    C5-2 Modeling interventions: A complex example
    C5-3 Interventions: Mask use, prophylaxis, therapy
    C5-4 Interventions: Isolation, quarantine, traffic limitations
    C5-5 All intervention in one model