Human Population and Evolutionary Genetics

Description

Plus de vingt ans après le premier séquençage du génome humain, une multitude de données génomiques a permis de décrire la diversité génétique humaine à un niveau de résolution sans précédent.Ces données massives ontamélioré notre compréhension de la démographie de notre espèce, notamment de sa dispersion autour du globe et du métissage des populations.

Des études basées sur l’ADN ancien ont démontré que les Néanderthaliens et Dénisoviens, des homininés maintenant disparus, ont contribué au génome des populations non-africaines modernes. La génétique des populations a également permis de mieux comprendre comment la sélection naturelle a contribué à la diversité du génome humain à l’échelle des populations. La détection des signatures moléculaires de la sélection naturelle dans le génome humain a permis l’identification des gènes à l’origine de la diversité morphologique et physiologique observée entre populations humaines actuelles.

L’objectif de ce MOOC est de donner les bases fondamentales de la génétique des populations appliquée à notre espèce, et de l’illustrer par de nombreux exemples.

Plan de cours

• Chapitre 1 – Diversité du génome humain et génétique des populations
  • Diversité du génome humain (Lluis Quintana-Murci)
  • Bases de données de variations génétiques des populations (Lluis Quintana-Murci)
  • Facteurs déterminant la diversité génétique: mutation et recombinaison (Laure Ségurel)
  • Facteurs déterminant la diversité génétique : dérive génétique (Paul Verdu)
  • Facteurs déterminant la diversité génétique : sélection naturelle (Etienne Patin)
• Chapitre 2 – L’histoire démographique des populations humaines
  • Méthodes d’inférence démographique (Etienne Patin)
  • Séparations et métissages des populations humaines (Paul Verdu)
  • Histoire génétique du continent Africain (Etienne Patin)
  • Histoire génétique du continent Européen (Samantha Brunel)
  • Histoire génétique de l’Asie, l’Australie et l’Océanie (François-Xavier Ricault)
  • Histoire génétique des Amériques (Javier Mendoza Revilla)
  • L’utilisation de pathogènes comme marqueurs des migrations humaines (Mary O’Neill)
  • Inférence des pratiques culturelles à travers la génétique (Raphaelle Chaix)
• Chapitre 3 - Histoire de l’adaptation des populations humaines
  • Méthodes de détection de la sélection naturelle (Etienne Patin)
  • Les effets de la sélection purificatrice sur le génome des populations humaines (Marie Lopez)
  • Adaptation aux ressources nutritionnelles (Laure Ségurel)
  • Adaptation au climat et aux conditions extrêmes (Javier Mendoza Revilla)
  • Adaptation aux agents pathogènes et aux maladies infectieuses (Lluis Quintana-Murci)
  • Les modèles alternatifs de l’adaptation (Etienne Patin)
• Chapitre 4 – Contribution de l’étude de l’ancien ADN à l’évolution humaine
  • Méthodes en paléogénomique (Ludovic Orlando)
  • Les hominidés archaïques et leur métissage avec les humains modernes (Ludovic Orlando)
  • Histoire récente à travers la loupe de l’ADN ancien (Céline Bon)
  • La nature adaptative de l’introgression archaïque (Maxime Rotival)
  • Engagement public et retour aux populations (Tamara Giles-Vernick)