YoVDO

تحليل المجموعات الهرمية باستخدام المسافات الإقليدية

Offered By: Coursera Project Network via Coursera

Tags

Bioinformatics Courses Data Analysis Courses Virology Courses

Course Description

Overview

بنهاية هذا المشروع ، ستنشئ برنامج Python باستخدام واجهة jupyter لتحليل مجموعة من الفيروسات وترسم مخططًا شجرياً أو دندوجرام بناءً على أوجه التشابه فيما بينها. سيعتمد الدندوجرام الذي ستقوم بإنشائه على ملف تعريف الانحراف التراكمي، والذي يعتمد بدوره على تركيبة النوكليوتيدات. ستستخدم تسلسل الجينوم الكامل للعديد من الفيروسات بما في ذلك، كورونا، وفيروس السارس، وفيروس نقص المناعة البشرية، وزيكا، وحمى الضنك، والفيروس المعوي، وفيروسات غرب النيل. ملاحظة: تعمل هذه الدورة التدريبية بشكل أفضل للمتعلمين المقيمين في منطقة أمريكا الشمالية. نعمل حاليًا على توفير نفس التجربة في مناطق أخرى.

Syllabus

  • تحليل المجموعات الهرمية باستخدام المسافات الإقليدية
    • للبدء، أوصي بأخذ بضع دقائق لاستكشاف موقع الدورة التدريبية. راجع المواد التي سنغطيها أثناء المشروع، وعاين المهام التي ستحتاج لإكمالها لاجتياز الدورة التدريبية. انقر فوق المناقشات لرؤية المنتديات حيث يمكنك مناقشة مواد الدورة التدريبية مع زملائك الطلاب الذين يحضرون الفصل. بنهاية هذا المشروع، ستنشئ برنامج Python باستخدام واجهة jupyter لتحليل مجموعة من الفيروسات وترسم مخططًا شجرياً dendrogram بناءً على أوجه التشابه فيما بينها. سيعتمد المخطط الذي ستقوم بإنشائه على ملف تعريف الانحراف التراكمي، والذي يعتمد بدوره على تركيب الجينوم من النوكليوتيدات. ستستخدم تسلسل الجينوم الكامل للعديد من الفيروسات بما في ذلك، كورونا ، وفيروس السارس، وفيروس نقص المناعة البشرية، وزيكا، وحمى الضنك، والفيروس المعوي، وفيروسات غرب النيل. إذا كانت لديك أسئلة حول محتوى الدورة التدريبية، فيرجى نشرها في المنتديات للحصول على المساعدة من الآخرين في مجتمع الدورة التدريبية. بالنسبة للمشكلات الفنية المتعلقة بمنصة كورسيرا، قم بزيارة مركز مساعدة المتعلم. حظًا سعيدًا عند البدء وأتمنى أن تستمتع بالدورة!

Taught by

Usama A. F. Khalil

Related Courses

Network Analysis in Systems Biology
Icahn School of Medicine at Mount Sinai via Coursera
Molecular Dynamics for Computational Discoveries in Science
University of Massachusetts Boston via Independent
Biology Meets Programming: Bioinformatics for Beginners
University of California, San Diego via Coursera
Python for Informatics: Exploring Information
Open Education by Blackboard
Genomic Medicine Gets Personal
Georgetown University via edX